Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SftpbP50405 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpbP50405 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms