Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms