Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms