Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms