Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms