Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3aP47708 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms