Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
InaP46660 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
InaP46660 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms