Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms