Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkx1-2P42580 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms