Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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