Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms