Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppm1bP36993 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppm1bP36993 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms