Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms