Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs1P35441 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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