Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms