Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2aP35436 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms