Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms