Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pola1P33609 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pola1P33609 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pola1P33609 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pola1P33609 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pola1P33609 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms