Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms