Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrm4P32211 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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