Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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