Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms