Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp2P29594 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms