Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcdP28867 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms