Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LoxP28301 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms