Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpl3P27659 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpl3P27659 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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