Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Xrcc5P27641 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Xrcc5P27641 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc5P27641 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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