Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChgaP26339 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChgaP26339 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms