Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms