Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms