Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr3aP23979 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms