Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms