Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps110-201ENSMUST00000117530 1094 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Myl1-201ENSMUST00000027151 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms