Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PparaP23204 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PparaP23204 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PparaP23204 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PparaP23204 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PparaP23204 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PparaP23204 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms