Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif3aP23116 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms