Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PenkP22005 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PenkP22005 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PenkP22005 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PenkP22005 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PenkP22005 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms