Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms