Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms