Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd1P19182 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms