Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms