Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms