Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18533 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18533 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18533 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18533 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18533 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18533 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18533 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18533 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18533 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18533 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms