Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18528 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18528 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms