Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18525 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18525 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18525 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18525 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms