Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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