Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs2P17534 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs2P17534 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs2P17534 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs2P17534 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms