Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp53P15975 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms