Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms