Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt1P13864 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt1P13864 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms