Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms